Mercurii-Orden har sin grund i 1800-talets Stockholm. Under 1859 samlades ett antal driftiga handelsanställda med visionen om att stärka gemenskap och samarbete inom yrkeskåren. Den 1 april 1860 instiftades Minuthandelsexpediternas Förbund – M.H.E.F., vilket senare ombildades till Mercurii-Orden.
Under decennierna som följde växte Orden i både storlek och verksamhet. Loger, högtider och välgörenhetsarbete blev återkommande inslag i brödernas liv. När näringslivet förändrades under 1900-talet öppnades Orden för fler yrkesgrupper. Detta gjorde att Mercurii-Orden kunde fortsätta utvecklas, samtidigt som den bevarade sin unika identitet.
Idag verkar Orden i de anrika lokalerna på Sjöfartshuset vid Skeppsbron i Stockholm, där tradition och gemenskap fortfarande är ledorden.